La instalación en nuestros propios servidores no suele ser la mejor idea salvo que nuestros alumnos estén en la misma red, como sería el caso de una Intranet.

Creo que es un error bastante clásico motivado por el síndrome del tecnocentrismo del que he hablado otras veces: preocuparse más por la tecnología que por la docencia.

Una opción interesante y económica, por los bajos requerimientos que tienen Moodle , Dokeos u otros LMS Open Source, es instalarlo en un hosting compartido. De este modo la empresa de hosting se encarga del mantenimiento del centro de datos y nosotros sólo nos preocupamos de la administración y la docencia sobre nuestra plataforma. El resultado final para el alumno es indistinto, tanto accediendo a nuestros servidores como a los de terceros.

Existen muchas empresas ofreciendo hosting con Moodle preinstalado a precios competitivos. Tienes un listado de Partners de Moodle que ofrecen hosting en moodle.org. Lo mismo ocurre con Dokeos, la propia empresa oferta su hosting y algunos proveedores de alojamiento web ofrecen Dokeos preinstalado.
Y aun en el caso de plataformas menos extendidas sigue siendo viable: por ejemplo ZillNet ofrece hosting de OpenACS que es lo que necesitas si quieres instalar dotLRN.

Cada vez que algún docente en una lista de correo o foro vuelve a comentar sus problemas con la tecnología suelo responderle lo mismo: busca una solución instalada y administrada por profesionales y dedícate a lo tuyo: enseñar.